散裂中子源科学中心主要负责中国散裂中子源（CSNS）的建设、开放与运行工作。作为我国首台、世界第四台脉冲型散裂中子源，CSNS被誉为探索物质微观结构的“超级显微镜”。它成功填补了国内在该领域的空白，为物质科学、生命科学、新能源、资源环境等国家发展战略的诸多领域，提供了一个先进的中子散射研究和应用的大型交叉平台。
自2018年通过国家验收并投入运行以来，CSNS已圆满完成15轮开放运行任务，吸引了全球超过1万名注册用户，完成了2500多项研究课题。从解析国产高铁车轮的内部残余应力，到揭示“超级钢”强韧化的新机理，再到实时观测锂电池充放电过程中锂离子的输运行为，一系列重大成果在能源、物理、材料、工程等多个前沿交叉领域涌现，显著提升了我国的自主创新能力。作为国家“十四五”重大项目，CSNS二期工程于2024年1月正式开工建设，目前升级建设已步入快车道。根据规划，二期工程全面建成后，CSNS的束流功率将提升至500千瓦，谱仪数量将增加到约20台，装置的探测能力和研究水平将实现倍增，实验精度和速度将大大提高。
在民生健康领域，中心科研团队取得了突破性进展。他们利用CSNS发展过程中积累的强流加速器和靶站技术，成功研发出用于硼中子俘获治疗（BNCT）的紧凑型装置，该装置在东莞市人民医院完成了首例临床治疗，为肿瘤患者带来了新的希望。